Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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COL24A1Q17RW2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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COL24A1Q17RW2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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COL24A1Q17RW2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL24A1Q17RW2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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