Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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