Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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