Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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