Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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