Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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