Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SP140Q13342 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP140Q13342 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP140Q13342 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SP140Q13342 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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