Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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TRAF1Q13077 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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