Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4DQ08499 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms