Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN11Q06124 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms