Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms