Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms