Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTA1P68133 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms