Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms