Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPAP53621 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPAP53621 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms