Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQGAP1P46940 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IQGAP1P46940 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms