Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms