Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSRP1P21291 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms