Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms