Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms