Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC1P02654 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC1P02654 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms