Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEBLO76041 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEBLO76041 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms