Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB3O43889 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms