Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSI1O43347 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MSI1O43347 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MSI1O43347 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MSI1O43347 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms