Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP2O14595 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP2O14595 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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