Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms