Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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