Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms