Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms