Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRAP3Q9Y2W1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms