Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP20Q9Y2K6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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