Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS3Q9UPU3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms