Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms