Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDRG4Q9ULP0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms