Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCF2Q9UG63 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms