Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK4Q9UBT3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms