Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms