Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms