Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms