Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP1Q9C000 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP1Q9C000 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms