Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms