Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms