Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms