Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms