Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SELENOMQ8WWX9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SELENOMQ8WWX9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms