Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf43Q8TAL5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms