Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NHLRC1Q6VVB1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms