Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms