Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYTL3Q4VX76 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms