Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDO1Q16878 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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